feat(phase4-5): add Workflow types and expand Skills ecosystem

Phase 4: Type System Completion (P2)
- Add comprehensive Workflow type definitions:
  - WorkflowStepType: hand, skill, agent, condition, parallel, delay
  - WorkflowStep: individual step configuration
  - Workflow: complete workflow definition
  - WorkflowRunStatus: pending, running, completed, failed, cancelled, paused
  - WorkflowRun: execution instance tracking
  - Request/Response types for API operations
  - Control types for pause/resume/cancel
- Update types/index.ts with workflow exports

Phase 5: Skills Ecosystem Expansion (P2)
- Add 5 new Skills with SKILL.md definitions:
  - git: Git version control operations
  - file-operations: File system operations
  - web-search: Web search capabilities
  - data-analysis: Data analysis and visualization
  - shell-command: Shell command execution
- Skills coverage now at 9/60+ (15%)

Documentation:
- Update SYSTEM_ANALYSIS.md Phase 4 & 5 status
- Mark Phase 4 as completed
- Update Phase 5 progress tracking

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>

skills/shell-command/SKILL.md

@@ -0,0 +1,174 @@
+---
+name: shell-command
+description: Shell 命令执行 - 执行终端命令、脚本运行、系统操作
+triggers:
+  - "执行命令"
+  - "运行"
+  - "shell"
+  - "terminal"
+  - "命令行"
+  - "终端"
+  - "运行脚本"
+  - "执行脚本"
+tools:
+  - bash
+---
+
+# Shell 命令执行
+
+执行终端命令、运行脚本、进行系统操作。
+
+## 能力
+
+- 命令执行：执行各种 shell 命令
+- 脚本运行：运行 bash/python/node 脚本
+- 系统操作：文件、进程、网络等系统命令
+- 管道操作：使用管道组合命令
+- 环境管理：管理环境变量和路径
+
+## 工具依赖
+
+- bash: 执行 shell 命令
+
+## 安全原则
+
+1. **危险命令确认**: 删除、格式化等危险操作需确认
+2. **权限最小化**: 使用最小必要权限
+3. **命令审查**: 执行前检查命令安全性
+4. **沙箱隔离**: 敏感操作在隔离环境执行
+
+## 常用命令分类
+
+### 文件操作
+
+```bash
+# 列出文件
+ls -la
+
+# 查找文件
+find . -name "*.ts"
+
+# 搜索内容
+grep -r "pattern" .
+
+# 文件权限
+chmod 755 script.sh
+```
+
+### 进程管理
+
+```bash
+# 查看进程
+ps aux | grep node
+
+# 终止进程
+kill <pid>
+
+# 后台运行
+nohup npm start &
+
+# 查看端口占用
+lsof -i :3000
+```
+
+### 网络操作
+
+```bash
+# HTTP 请求
+curl -X GET https://api.example.com
+
+# 下载文件
+wget https://example.com/file.zip
+
+# 检查网络
+ping google.com
+
+# DNS 查询
+nslookup example.com
+```
+
+### 开发工具
+
+```bash
+# Node.js
+npm install
+npm run build
+npm test
+
+# Python
+pip install -r requirements.txt
+python script.py
+
+# Git
+git status
+git commit -m "message"
+```
+
+### 系统信息
+
+```bash
+# 系统版本
+uname -a
+
+# 磁盘空间
+df -h
+
+# 内存使用
+free -m
+
+# CPU 信息
+cat /proc/cpuinfo
+```
+
+## 示例用法
+
+```
+用户: 运行 npm run build 构建项目
+助手: 执行构建命令...
+
+$ npm run build
+
+> project@1.0.0 build
+> vite build
+
+vite v5.0.0 building for production...
+✓ 42 modules transformed.
+dist/index.html        0.45 kB
+dist/assets/index.js   125.00 kB
+dist/assets/index.css  15.00 kB
+✓ built in 2.5s
+
+构建成功！输出文件位于 dist/ 目录。
+```
+
+```
+用户: 查看当前目录下最大的 5 个文件
+助手: 执行命令...
+
+$ du -ah . | sort -rh | head -5
+
+1.2G    ./node_modules
+450M    ./dist
+120M    ./coverage
+85M     ./node_modules/typescript
+72M     ./node_modules/@types
+
+最大的 5 个文件/目录已列出。
+```
+
+## 输出规范
+
+- 显示执行的完整命令
+- 显示命令的标准输出和错误输出
+- 中文描述命令结果
+- 错误时提供可能的原因和解决方案
+- 长输出进行适当截断和摘要
+
+## 错误处理
+
+遇到命令执行失败时：
+
+1. 显示完整的错误信息
+2. 分析可能的原因
+3. 提供解决建议
+4. 如需要，提供替代方案